Le premier cycle correspond aux trois premières années d’étude de médecine : la 1ère année est un tronc commun entre toutes les professions de médecine. Les 2ème et 3ème années permettent de préparer la licence (le Diplôme de Formation Approfondie en Sciences Médicales - DFGSM).

2ème année : stage d’initiation aux soins infirmiers (4 semaines)

Premier stage obligatoire, le stage d'initiation aux soins infirmiers dure 4 semaines, à temps complet et de manière continue, dans un établissement hospitalier. Il est réalisé à la rentrée de la deuxième année d’étude.
L'étudiant s'initie aux principes de l'hygiène hospitalière et aux gestes de premier secours. Il découvre le fonctionnement d’une équipe soignante.

2ème et 3ème année : stages cliniques d'initiation aux fonctions hospitalières (400 heures)

Ces stages permettent d'appliquer les connaissances théoriques et d'acquérir les compétences en particulier lors de l'entretien avec le patient et lors de son examen clinique.

Après la licence, les étudiants en médecine entrent dans un aspect plus concret de leur formation. Ils deviennent «étudiants hospitaliers» et partagent donc leur temps entre l’hôpital et la faculté. Ils préparent pendant trois ans leur diplôme de formation approfondie en sciences médicales (DFASM).

Durant 3 ans, les étudiants enchaînent quatre stages de trois mois dans des services de spécialités (pédiatrie, gynécologie, urgence, chirurgie, médecine interne et obstétrique). Les stages se font en alternance avec les cours à l’université. Le rythme varie selon les établissements.

Stages en unités hospitalières de soins

L'organisation de ces stages relève de chaque faculté. Ils ont une durée de 6 à 8 semaines à temps plein ou de 12 à 16 semaines à mi-temps. Ils sont choisis, selon les facultés, en début d'année ou de trimestre, soit par classement au mérite, soit par classement alphabétique. 

Ils permettent la mise en situation pratique du futur médecin dans un ensemble de situations cliniques correspondant aux objectifs de sa formation.
Ils s'effectuent dans les unités de soins où l'étudiant participe à l'activité hospitalière, en vue de l'acquisition des compétences prévues dans le carnet de stage.
Chaque étudiant réalise un stage en chirurgie et un stage dans une unité d'accueil des urgences, ou de réanimation, ou de soins intensifs.

Stage obligatoire de médecine générale

Ce stage obligatoire se déroule chez un ou des médecins généralistes agréé(s)-maître(s) de stage  des universités. Il se déroule au sein d'un cabinet individuel ou de groupe, d'une maison/centre ou d’un pôle de santé.

Il doit permettre à l'externe d'appréhender la relation médecin-patient en médecine générale et la place du médecin généraliste au sein du système de santé, de découvrir les spécificités de l'exercice de la médecine générale en liaison avec l'ensemble des professionnels dans le cadre d'une structure ambulatoire de premier recours, ou encore de comprendre les modalités de gestion d'une structure ambulatoire.

Après la 6ème année d’étude, les étudiants en médecine passent les épreuves classantes nationales (ECN).
En fonction de leur classement, ils choisissent leur centre hospitalier universitaire d’affectation et leur spécialité.

La durée de l’internat varie selon les spécialités
Pour les médecins généralistes, elle est de 3 ans et va jusqu’à 5 ans pour les spécialités chirurgicales (y compris l’obstétrique). Les étudiants effectuent au moins six stages de six mois chacun tout en suivant des cours théoriques en parallèle.

Stages de spécialité

L'interne doit valider l'ensemble des stages de 6 mois requis pour l'obtention de son diplôme d'études spécialisées. Le nombre de stages varie en fonction de la spécialité poursuivie. Ces stages peuvent être hospitaliers, en structures de soins extrahospitalières ou effectués auprès de praticiens en ambulatoire.

Stage ambulatoire de soins primaires en autonomie supervisée (SASPAS)

Ce stage est ouvert aux internes de médecine générale en 5^ème ou 6^ème semestre du 3^ème cycle, qui ont déjà effectué un stage ambulatoire chez un praticien.

D'une durée hebdomadaire de 11 demi-journées, il comporte à minima 4 demi-journées en cabinet de médecine générale et 2 demi-journées en formation universitaire ou personnelle.